ساماندهی موزه ژئوپارک قشم در 3 فاز برنامه ریزی شد که فاز اول در بخش های ورود و خروج و نوسازی و ایمن سازی جهت ارائه بهتر خدمات به بازدیدکنندگان صورت پذیرفت. فاز دوم با هدف آشنا سازی و ارائه اطلاعات بصری از شرایط پارینه سنگی جزیره و شیوه سکونت اولیه در ژئوسایت بام قشم آغاز گردید. در این راستا مدیریت ژئوپارک با استفاده از طراحی کم نظیر و هنرمندی آقای آزادبخت از هنرمندان برجسته در طراحی موزه طبیعی ایران بهره جست و تصویری زیبا از سبک زندگی آن عصر با بکارگیری ماکت، مجسمه، نقاشی و جلوه های نورپردازی شبیه سازی نمود